「独自SSL（無料）を設定する」ボタンをクリック後、「SSLを設定できませんでした。」と表示されて申込むことができません

対象ドメインで運営中のサイトが、「Google SafeBrowsing」で安全ではないと判断されていることが原因です。

「Google SafeBrowsing」で安全ではないサイトと判断されている場合、無料SSLをお申込みいただくことができません。
Google側での判断となり、当サービス側では安全ではないと判断されている理由を特定することができかねますので、以下のようなGoogleのサイトをご活用いただき、安全なサイトと判断されるよう対応を行ってください。

セーフ ブラウジング：不正なソフトウェアとフィッシング – Google 透明性レポート
セーフ ブラウジングに関するよく ある質問 - Transparency Report ヘルプ

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